본 발명은 신규한 지의류 내생 곰팡이의 추출물을 유효성분으로 포함하는 대장암 줄기세포 성장억제용 조성물에 관한 것으로, 세트라리아 속 (Cetraria sp.) 지의류 로부터 분리된 신규 지의류 내생 곰팡이 EL001672 (KACC 83021BP) 추출물은 대장암 줄기세포 표지자인 ALDH-1, CD133, CD44, Lgr-5 및 Msi-1의 발현을 억제하고, 대장암 줄기세포의 사멸을 유도하며, 대장암 줄기세포의 자가재생 및 암세포로의 분화를 억제시키는 효과를 나타내므로 종양줄기세포 성장 억제용 조성물의 유효성분으로 유용하게 사용될 수 있다.