본 발명은 치주 질환 진단용 바이오마커 및 이를 이용한 진단키트에 관한 것으로, 보다 구체적으로 정상인의 타액보다 치주 질환 환자의 타액에서 상대적으로 높은 발현 수준을 나타내거나 낮은 발현 수준을 나타내는 대사물질을 검출함으로써, 기존 유전자, RNA 또는 단백질 바이오마커 보다 유의적인 마커로 활용 가능한 치주 질환 진단용 바이오마커 및 이를 이용한 진단키트에 관한 것이다.