본 발명은 사이버물리시스템의 고가용성 보장을 위한 악성코드 대응 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 사이버물리시스템의 네트워크 메시지로부터 예상되는 악성코드를 식별한 후, 식별된 악성코드가 유발할 수 있는 공격 트리 모델을 기반으로 방화벽 설정 파일을 생성하여 악성코드가 전파될 수 있는 네트워크 구간에 해당하는 기기들로 전송함으로써, 제로 데이 공격에 대한 빠른 대처가 가능하고 피해를 최소화할 수 있는 사이버물리시스템의 고가용성 보장을 위한 악성코드 대응 방법에 관한 것이다.